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牡丹江医学院2021在全国本科院校排名第690位，强于第691名的池州学院，第692名的汉口学院，第693名的喀什大学，第694名的宁德师范学院，第695名的滇西科技师范学院。在黑龙江排第21名，强于第22名的齐齐哈尔医学院，第23名的黑河学院，第24名的黑龙江东方学院，第25名的大庆师范学院，第26名的绥化学院。

竞争力排名 年份 全国本科排名 院校名称 省份 省内排名 2021 690 牡丹江医学院 黑龙江 21 2020 668 牡丹江医学院 黑龙江 20 2019 694 牡丹江医学院 黑龙江 22 2018 736 牡丹江医学院 黑龙江 25 2017 698 牡丹江医学院 黑龙江 25

综合实力排名（校友会版）

在全国本科院校排名第560位，在黑龙江排第23名。

校友会排名 年份 全国本科排名 院校名称 省份 省内排名 2020 560 牡丹江医学院 黑龙江 23 2019 604 牡丹江医学院 黑龙江 20 2018 518 牡丹江医学院 黑龙江 19 2017 569 牡丹江医学院 黑龙江 19

综合实力排名（软科版）

在全国本科院校排名第391位，在黑龙江排第13名。

软科排名 年份 全国本科排名 院校名称 省份 省内排名 2018 391 牡丹江医学院 黑龙江 13 2017 474 牡丹江医学院 黑龙江 17